På det seneste er det blevet stadig sværere for bien i Bee vs flyvende tallerkener at finde blomsterlysninger for at samle nektar. Du skal flyve langt til steder, der ikke er så sikre. Forskellige forhindringer dukker op på biens flyvevej, inklusive usædvanlige - flyvende tallerkener. Bien er ikke længere overrasket over noget, verden er vendt på hovedet, og du kan forvente alt. Heltinden er fokuseret på at samle blomster, og du vil hjælpe hende. Og hun vil skyde kridtkugler mod rumvæsner. Fra dem mister pladen med rumvæsnerne synet og falder til jorden. Målet i Bee vs flyvende tallerkener er at guide bien så langt som muligt og samle så mange blomster som muligt.