Der findes forladte byer, og det er et velkendt faktum, men du kunne aldrig forestille dig, at du ville finde dig selv i en af dem i Mystery Town Escape. Dagen før besluttede du dig for at besøge din familie, hoppede ind i bilen og kørte på vejen. Vejen var velkendt og tog normalt ikke mere end fire timer. Men efter at have kørt halvvejs stødte man pludselig på reparationsarbejde, og vejskilte indikerede en omvej ad en grusvej, som kunne strække sig over flere kilometer. Halvvejs er passeret, du vil ikke tilbage, så du kom videre. Vejen viste sig at være ukendt og stadig mere ildevarslende, og snart dukkede en by op i horisonten. Du beslutter dig for at stoppe, få noget at spise og tanke op. Men byen viste sig at være helt tom og forfalden. Hvor man kan få brændstof og mad er et problem i Mystery Town Escape.