Frøen i Clumpsy Frogger 2D har intet valg, da hans hjemmedam begynder at blive gravet op og ryddet for at blive en koi-opdræt. Frøen bliver nødt til at lede efter et andet opholdssted. Det er godt, at den nærmeste dam er på tværs af vejen, men der er en endeløs strøm af trafik, der suser langs vejen. Og vejen følges af en flod i hastig bevægelse, langs hvilken tømmer lige nu flydes. Frøen bliver nødt til at manøvrere mellem biler og derefter hoppe på logs, og hvem kan hjælpe ham, hvis ikke dig i Clumpsy Frogger 2D.