Enhver form for aktivitet kræver professionalisme, men i nogle erhverv er det også nødvendigt at iagttage visse moralske aspekter, og det gælder især forskellige videnskabelige udviklinger, der kan skade mennesker. Helten i spillet Secret Lab Chronicles, professor Benjamin, modtog et fristende tilbud om at arbejde i et privat laboratorium på nogle hemmelige eksperimenter. Han besluttede at gå med, men da han begyndte at arbejde, indså han, at hvis eksperimenterne lykkedes, ville menneskeheden stå over for en anden trussel om fremkomsten af et våben, der ikke kunne sammenlignes med nogen af de eksisterende. Helten ønsker at afsløre alle, der står bag oprettelsen og driften af laboratoriet, men han har brug for beviser, og du skal samle dem i Secret Lab Chronicles.
