En alvorlig fare lurer over byen snart, den vil blive angrebet af et kæmpestort, skræmmende monster, og superhelten, som bliver opfordret til at vogte byfolks sikkerhed, befinder sig fuldstændig magtesløs i Energy Superman 3D. Hans superevne er energibolde, som han kaster mod fjenden og dermed kan ødelægge ham. Men periodisk kræver helten genopladning, især hvis han skulle bruge sin energi dagen før. I spillet Energy Superman 3D er dette præcis situationen, og helten, før han møder fjenden, skal akkumulere energi, og i dette vil du hjælpe helten ved målstregen, klikke på skalaen, så superhelten angriber fjenden og besejrer ham i Energy Superman 3D.
