Vennerne Zoro og Luffy vil finde One Piece-skatten for at blive de mest berømte pirater, og Luffy ønsker at blive deres konge. I mellemtiden leder han et lille hold stråhattepirater, som seriøse pirater ikke betragter som konkurrenter. I spillet One Piece Pirate Battle vil heltene udforske øerne i Grand Line, og de vil ikke undgå eventyr. Ikke kun pirater, men også regeringen er på jagt efter skatten. Det er ikke interesseret i at styrke sørøverne. Derfor bliver heltene nødt til at kæmpe mod både den kongelige hær og bøllerne og banditterne i One Piece Pirate Battle. To personer kan spille.
