Kloning er blevet brugt mere end en eller to gange i spilverdenen som en løsning på problemer med udførelsen af problemer. Quantum Split vil også bruge dette princip. Pixelhelten i den sorte farve faldt ned i platformen Labyrinth, og for at komme ud af den har han brug for sin egen klon. På de indledende niveauer er han ikke nødvendig, helten vil passere alle hindringer. Han ved, hvordan man hopper højt, og at overvinde barrierer er ikke vanskeligt. Imidlertid vises farlige fælder yderligere, hvilket kan fjernes ved at trykke på en stor rød knap. Dette har brug for en klon. Klik på R -tasten, og en hvid klon vises. Han vil gentage de tidligere handlinger fra sin prototype i kvanteopdelingen.
