Helten i spillet Wacky Nursery inviterer dig til at kaste dig ned i pixelverdenen og hjælpe helten med at forstå situationen. Karakteren af spillet er en dreng, der netop har gået i børnehaven. I dag er den første dag i en nybegynder, og han er nødt til at blive bekendt med både børn og undervisere. Efter at have krydset tærsklen i haven, følte helten imidlertid straks noget galt. Lærere opfører sig underligt, de spiser ikke mad i spisestuen, men ægte skråninger. Drengen er klar til at komme ud af dette forfærdelige sted, men kan ikke gøre det, fordi han kom ind i en midlertidig løkke, på den såkaldte Growal. For at bryde ud af det, skal du bruge logik og opfindsomhed i skøre børnehave.
