De bobler, som du vil manipulere i Bubbly-fusionsbønspelet, er ikke enkle. Inde i hver boble er der en slags genstand eller væsen, og dette er vigtigt for opgaven på hvert niveau. Du vil se mål i øverste højre hjørne. For at opfylde dem er det nødvendigt at støde på bobler med den samme fyldning for at få nye bobler, de skal også kombineres ved hjælp af en fusion for at få resultatet i den boblende fusion. På hvert niveau, udførelse af opgaven, renser du samtidig feltet helt fra boblerne. Hvis der ud over dem vises bokse eller andre genstande på marken, skal du ramme dem for at åbne indholdet i dem i boblende fusion.
