I lageret med Clicky Crates skete der noget utroligt. Alle kasser, roligt stod på deres steder, begyndte uventet at hoppe op og i efteråret for at bryde. På denne måde i lageret har snart intet at forblive i lageret. Du skal dybt trykke på kasserne, så de forbliver intakte. Alt andet undtagen kasser kan ikke røres. Men hvis du går glip af tre kasser, vil spillet kaste dig ud af webstedet. I alt har Clicky Crates-spillet tre vanskelighedsniveauer: enkle, mellemstore og komplekse.
