Spøgelser er sjæle, der ikke omfavner fred. Naturligvis glæder dette dem ikke, så oftest er de vrede, klar til at hælde deres vrede over alle, der vises inden for deres aktivitet. I Ghost Assassin-spillet hjælper du et af sådanne onde spøgelser, der længe har været i limbo og fra dette endnu vigtigere. One6ako for ikke længe siden havde et håb om ro til at slappe af. For at gøre dette skal du indsamle et tilstrækkeligt antal forbandede kranier. Kranierne ligger ikke noget sted, de kan findes på bestemte steder, men det er disse steder, der er beskyttet af vagterne. En kollision med dem er dødelig for spøgelset. Gå derfor ikke ind i den røde zone, og hvis du vil angribe, skal du gå fra den mørke side til Ghost Assassin.
