Fire Boy og Droplet tager traditionelt på en rejse sammen, men i Fire Boy Run Adventure styrer du kun Fireboy. Hans kæreste er forsvundet, og han leder efter hende. Helten bliver nødt til at overvinde forskellige forhindringer ved at hoppe på platforme. Forskellige mutante planter vil forsøge at stoppe ham, vær særlig opmærksom på de udragende rør. Når han hopper på dem, vil helten falde igennem, og hvor han vil falde ud, er interessant. Du bliver nødt til at eksperimentere for at finde ud af, hvilken pibe der er bedst ikke at gå ind i i Fire Boy Run Adventure.
