Helten i spillet Ninja Jump fighting er en ninja, der værdsætter sit ry. Han bekæmper det onde og udrydder det efter bedste evne. Men det er let at ødelægge et ry, og det skete for vores helt. I byen, hvor helten bor, er der dukket ninjaer op, som er involveret i ulovlige aktiviteter, og uskyldige mennesker lider under dem. Dette påvirker helten og ønsker ikke at håndtere og straffe de bedragere, der nedgør ham. Hjælp helten, der er ude på jagt efter skurke i Ninja Jump-kampe. Du bliver nødt til at hoppe på bygninger og vælte skurke.
