I Praefectus spillet vil du lede en af de byer i det gamle Rom, som du skal bygge først. Du er blevet betroet opførelsen af Capua, en gammel by, der var berømt for sine gladiatorer og god vin. Som hovedet vil du opbygge bygninger, udvinde ressourcer og naturligvis beskytte byen mod razzier. Brug de ressourcer, du har på lager, og udvikle infrastruktur. Byg huse for at øge befolkningen i byen, statuer af guder til at inspirere folk, gårde til fødevareproduktion og meget mere. Hold styr på din kapital, ikke at blive efterladt uden midler og opret den bedste by.