Fra de fjerne dybder af rummet mod planeten bevæger sig en armada af fremmede skibe. De vil angribe vores planet og fange den. Du i Exxtroider-spillet på dit skib bliver nødt til at opfange dem og ødelægge dem. Når du er gået en vis afstand, vil du begynde at skyde fra dine luftbårne kanoner. Dine skaller, der kommer ind i fjendens skibe, vil skade dem og ødelægge dem. For hvert nedskibet skib får du point. De skyder også mod dig, og du bliver nødt til at manøvrere dine fly dygtigt ud fra angreb fra fjender.
