Vira har erklæret krig mod menneskeheden og vinder indtil videre, men folk opgiver ikke at prøve hurtigt at finde en vaccine. I spillet er der i mellemtiden allerede blevet opfundet en livreddende vaccine og ikke kun en, men til forskellige typer vira, der formerer sig med lydhastigheden. I spillet Kill The Virus vil du blive en rigtig morder af vira. De vil opstå foran dig, en mere forfærdelig end en anden. Kast dem fyldt med sprøjter og prøv at være opmærksomme og nøjagtige. Du kan ikke komme ind i den allerede fastlagte sprøjte, ellers overlever det virale monster og glider. For at passere niveauet skal du skyde alle de forberedte vacciner.
