Fra portaler, der dukkede op forskellige steder på vores planet, strømmede horder af levende døde ud i vores verden. Nu afhænger verdens skæbne af en gruppe superhelte, som skal ødelægge alle zombier. I Super Heroes vs Zombie vil du slutte dig til dem i denne kamp. I begyndelsen af spillet vil du være i stand til at vælge din karakter og det våben, som han vil være bevæbnet med. Derefter vil din helt være i et område, hvor der vil være zombier overalt. Din opgave er hurtigt at orientere dig for at sigte på dem synet af dit våben og åben ild for at dræbe. Ved at skyde nøjagtigt vil du ødelægge zombier, og for hver besejret fjende får du point. Efter at have akkumuleret en vis mængde af dem, kan du købe dig nye typer ammunition eller købe andre våben.