Mickey Mouse har fremsat en anmodning til dig i Bubble Shooter Rainbow om, at du frigør alle hans venner. Derudover er der også Mini's elskede kæreste fra fangenskab. Tegneseriefigurerne fanges og fanges af ingen ringere end farverige bobler. Det lyder latterligt, men det er faktisk meget alvorligt. Regnbue-bobler-bolde fløj ind i en enorm sky og hældte ud og fyldte alle nicher med sig selv. Den, der var på gaden på det tidspunkt, faldt under dem og kan nu ikke komme ud. På hvert niveau af Bubble Shooter Rainbow-spillet skal du ødelægge et bestemt antal bobler i den ønskede farve. Mickey viser dem for dig. For at gøre dette skal du klikke på grupper af identiske bolde, der skal være mindst to af dem.