Ultra Pixel Survive tager dig med til pixelverdenen. En ung fyr ved navn Thomas bor her. I dag tager vores helt på en rejse over landet, og du vil følge ham. Foran dig på skærmen vil du se din karakter, som vil være i et bestemt område. Ved hjælp af kontroltasterne får du din helt til at gå fremad. På vejen vil din helt møde forskellige fælder og andre farer, som han bliver nødt til at overvinde under din vejledning. Nogle gange vil karakteren støde på forskellige monstre og vilde dyr. Du kan ødelægge dem ved hjælp af en række forskellige våben, som din helt har i sin beholdning.
