En hær af de levende døde invaderede planteriget. Bevæger sig langs vejen mod hovedstaden, ødelægger det alt på sin vej. I Plants vs Zombies TD vil du styre forsvaret af hovedstaden. Et bestemt område vil være synligt på skærmen foran dig. Du bliver nødt til at identificere strategisk vigtige steder. Derefter vil du ved hjælp af et specielt kontrolpanel bygge defensive strukturer på disse steder samt opdrage blomstersoldater. Når zombier kommer tæt på dem, åbner dine planter ild og ødelægger fjenden. For hver dræbt zombie får du point.
