Dyk ned i Planktoon -spillet, og du vil øjeblikkeligt blive omgivet af mange grønne udefinerede væsner. Dette er plankton, som i virkelige forhold er praktisk talt usynligt for det menneskelige øje, men mange marine indbyggere elsker det. Det er et næringsmedium, og når mængden falder, påvirker det øjeblikkeligt økosystemet. Du vil hjælpe plankton med at leve og udvikle sig, og du vil også modtage nyttige stoffer fra det. De forbliver i form af gule pletter, og du skal klikke på dem meget hurtigt for at hente dem. Undervejs, fang hjerter for at genopbygge liv og klik ikke på selve planktonet, dette vil blive betragtet som en fejl, og du vil miste dit hjerte i Planktoon.