Alt vendt på hovedet i spilverdenen. I det engang fredelige Mushroom Kingdom, hvor det altid var roligt, og kun svampe eller skildpadder kunne lege sjov, begyndte der at dukke virkelig farlige fjender op - det er zombier. Det var ikke første gang, at Mario måtte tage et kraftfuldt våben for at modstå invasionen, ellers ville verden ende. I Super Mario Shooting Zombie kan du hjælpe helten med at slå ghouls ud af de steder, hvor de forventede at gemme sig og skjule indtil bedre tider. Du skal få de udøde fra alle steder ved at bruge alle de genstande, der er til rådighed, samt ricochet i Super Mario Shooting Zombie.