Mennesket betragter sig selv som naturens konge og behandler andre skabninger nedadgående og respekterer kun styrke, størrelse og magt. Og insekter har ikke noget lignende, vel, bortset fra at de kan stikke smertefuldt. Nogle insekter, som er giftige, er folk bange for, og såsom fluer, foragter de ærligt og forsøger at ødelægge på enhver mulig måde. Til dette opfindes forskellige midler, fra en almindelig fluesmækker til ultralydsapparater, stickies og andre fælder. I Smash The Flies skal du bekæmpe en hel sværm af fluer, og det er ikke simple insekter, som du ser hver dag derhjemme. Vores fluer kravler op af jorden eller dynger af hø, og din opgave er at knuse dem, ikke at tillade dem at flygte ud af marken. Rør ikke ved de røde insekter i Smash The Flies.
