Hver gang en virus eller et andet uønsket stof forsøger at trænge ind i din krop og etablere sine egne regler der, begynder immunsystemet at kæmpe tilbage. I spillet Immune system Command vil du se dette fra første hånd og endda være i stand til at hjælpe systemet med at afvise angreb udefra. Denne gang udsættes kroppen for et rasende angreb af forskellige vira. De vises til højre, til venstre, flyver fra oven. Du skal klikke på elementerne nedenfor, så de frigiver antistoffer mod vira og bakterier, der vil ødelægge skurkene, og de vil ikke være i stand til at nå deres mål - ødelæggelse i Immunsystem Command.