En gul stickman ved navn Tom er i alvorlige problemer i Run Tom - Escape. På grund af rummets brydning blev han transporteret til en parallel verden. Alt ville være fint, men der er en jagt på sådanne bosættere, og generelt viste verden sig at være et ret farligt sted, den er fuld af fælder og andre problemer. Tom skal omhyggeligt søge flere steder for at samle de genstande, der er nødvendige for at vende hjem. Bevæbnede lokale vil ligge og vente på din helt på vejen, og du, efter at have gået i kamp med dem, bliver nødt til at ødelægge fjenden ved at bruge dine våben til dette. For hver dræbt fjende får du point i spillet Run Tom - Escape, og du vil også være i stand til at hente trofæer, der er faldet ud af den, og gøre det nemmere for dig selv at bestå spillet.