Frugtninjaen er tilbage i rækken i Samurai Slash 3D, og han er allerede en samurai, hvilket betyder, at han vil have sværere opgaver. At stå ét sted og skære hoppende frugter i luften er lille, helten vil race langs stien til målstregen og skære frugtbarrierer på vejen. Først vil det være individuelle frugter af store størrelser, så vil deres antal stige, og de bliver mindre. Du skal skære hver frugt, bær eller nød, så barrieren anses for bestået. Hvis du ikke når det i tide, bliver du nødt til at starte forfra i Samurai Slash 3D. Hastighed og nøjagtighed er vigtig. Beregn din styrke korrekt, og helten vil hurtigt kunne bestå niveauerne.