I Wizard School-spillet kommer du til en verden, hvor der stadig fødes børn, som har forskellige magiske evner. For at lære at bruge dem går de på en specialskole for tryllekunstnere. Din karakter vil også starte sin rejse som elev i den. Han bliver nødt til at lære at bruge en magisk stav og anvende forskellige besværgelser. For at gøre dette bliver han nødt til at udføre opgaver, som vil blive givet til ham af lærere. For at karakteren kan klare opgaverne i spillet, er der hints. Du vil blive angivet af rækkefølgen af dine handlinger. Ved at følge dem vil du være i stand til at udføre alle opgaverne og blive en tryllekunstner. Herefter vil du som lærer på samme skole kunne udvikle dit eget stavesystem og undervise andre elever.