Den modige helt Batman trængte ind i en gal videnskabsmands hemmelige laboratorium. Vores helt aktiverede ved et uheld sikkerhedssystemet, og nu er laboratoriet blokeret, og alle udgange er blokeret. En timer tæller ned på væggen, og når den når nul, vil der gå gas ud, som vil dræbe alt liv i lokalerne. Du i spillet Batman Escape bliver nødt til at hjælpe helten med at komme ud af disse problemer. Sammen med Batman bliver du nødt til at løbe gennem laboratoriets lokaler og omhyggeligt undersøge alt. Når du løser forskellige slags gåder og rebus, bliver du nødt til at samle skjulte genstande, som din helt vil være i stand til at komme ud af laboratoriet med.