En ung sømand skal beskytte sit skib mod pirater i Bubble Shooter. En hel sky af flerfarvede bolde har koncentreret sig over hans skib, og alle kan falde på dækket og sænke skibet på et øjeblik. For at forhindre dette skal du skyde, så der er tre eller flere identiske bobler ved siden af hinanden. Dette vil ødelægge dem. Således vil du hjælpe helten med at eliminere truslen. Den bold, der allerede er ladet i kanonen, vil skyde, og ikke den, som fyren holder i hænderne og står i nærheden. Dette er nogle gange forvirrende i Bubble Shooter.