Mario er mere almindeligt set rejse gennem svampeverdenen, hvor onde svampe og snegle forgriber sig på ham. Blikkenslageren måtte springe over dem eller omgå dem. Men i Super Mario Physics-spillet vil Mario ikke rokke sig, mens den nyttige grønkappede svamp skulle falde lige i heltens hænder. Sådanne svampe støder normalt sjældent på den rejsendes vej. Det er ikke almindelige svampe, men magiske. Efter at have spist sådan en svamp, bliver helten ikke bare Mario, men Super. For at svampen kan komme til helten, er det nødvendigt at fjerne alle forhindringer på dens vej og derefter klikke på den og fjerne boksen, så svampen kan vugge ned ad et skråplan eller trin i Super Mario Physics.