Sonic løber ikke kun hurtigt, helten besluttede at prøve lykken under flugten, og hans forsøg kan være fatalt, hvis du ikke hjælper pindsvinet i Flappy Sonic. Det er nødvendigt at klikke på karakteren, så han ændrer flyvehøjden. Dette er nødvendigt, ellers vil han ikke være i stand til at flyve mellem rørene, der stikker ud både nedefra og ovenfra, og mellem dem er der kun en lille tom åbning, som du skal slippe igennem og ikke ramme dem. Vær kvik og kvik, så Sonic ikke styrter ind i et andet rør i Flappy Sonic.