Alarmen har spredt sig over nogle områder af Minecraft. Det betyder, at enten zombier eller terrorister er blevet aktive der. Dit hold skal ankomme på kommando til en oprydningsmission i Pixel Zombie Suvival Toonfare. Når du først var på plads, indså du, at dine mål denne gang vil være tegneseriezombier. Disse er tegneseriefigurer, som efter at være blevet inficeret med zombievirussen besluttede at gemme sig i den blokerede verdens store territorier. Men de vil ikke lykkes. Du vil finde og ødelægge alle, så virussen ikke spredes yderligere. Du kan spille i et hold eller alene. Valget af placering er dit, ligesom antallet af mål i Pixel Zombie Suvival Toonfare.