Flerfarvede bobler med numeriske værdier på siderne vil flyde hen over spillefeltet i Num Bubbles Merging. Det er de elementer, du vil manipulere. Øverst i informationspanelet vil en opgave dukke op - at skabe en boble med en eller anden værdi. Du skal forbinde to eller flere bobler for at få det, du har brug for i alt. På hvert niveau skal du have ti bolde i henhold til opgaverne. Hvis der ikke er et par kugler med de rigtige tal, skal du først forbinde andre bobler, indtil du får det, du skal bruge. Den resulterende bold forsvinder fra banen. Og du får en ny opgave i Num Bubbles Merging.