Tre ninjakrigere er involveret i spillet Gone Rogue. Sorte Kuro, der dygtigt kaster shurikens, han har ingen lige i dette. Den røde kriger Aka er så god til at svinge et sværd, at alle er forbløffede. Derudover har Akis sværd magiske evner, det kan bremse fjenden, hvis det gør ondt på ham. Den grønne ninja Midori er en taktiker. Han sætter dygtigt fælder forskellige steder, så fjenden helt sikkert vil snuble over dem. Alle tre krigere optrådte i Gone Rogue af en grund. De blev sendt af kejseren, så heltene håndterer skurken Uzuri, som plyndrer en af de største landsbyer i imperiet. Du skal ødelægge fjenden, før han samler alle produkterne i Gone Rogue.