Heltene Bleach og Naruto vil kæmpe igen og sætte deres hold i ringen. Disse karismatiske anime-figurer er helten i forskellige mangaer, men i spillet Bleach Vs Naruto 3. 3 ender de sammen og præsenterer deres hold for dig. Der er i alt 48 helte i spillet, og dette inkluderer ikke femogtredive udfordringsfigurer. Vælg et hold og derefter en helt, blandt dem finder du, ud over de mest berømte: Naruto og Bleach, mindre berømte, men ikke mindre magtfulde: Kaptajn Soifon, Uryu Ishida, Madara Uchiha, Karin Uzumaki, Yugo, Deidara, Orochimara og andre. Når du har valgt et hold, skal du vælge din karakter og gå ind i ringen med ham for at kæmpe. Du kan spille i to-spiller eller single player mode. Du kan også deltage i turneringen i Bleach Vs Naruto 3. 3.