Ikke alle kæledyr lever godt sammen med deres ejere, men de fleste af dem tåler oftest simpelthen dårlig behandling, men der er også dem, der tør løbe og helten i spillet Pet Runner er en af dem. Han besluttede at stikke af så langt som muligt fra det sted, hvor han levede dårligt. Så snart muligheden bød sig, løb han. Men stien er fuld af forskellige forhindringer. På trods af at helten løber gennem ørkenen, er den ikke helt øde. På vejen vil der være sten, kaktusser og andre forhindringer, som du skal hoppe over ved at trykke på pil op. Hvis du støder på en lavtflyvende fugl, skal du dukke dig ned ved at trykke på pil ned i Pet Runner.