Din opgave i Base Defense 3D er at sikre basens sikkerhed, omkring hvilken horder af zombier begynder at samle sig. Hvis du ikke gør noget, vil horder af udøde bryde gennem portene, vælte væggene og ødelægge alle, der gemmer sig i basen. Det er nødvendigt at tilføje så mange skydetårne som muligt og placere dem rundt om hele omkredsen. De vil skyde i automatisk tilstand. Helten skal med jævne mellemrum hoppe uden for basen for at samle fangede bundter af sedler og bruge dem på at styrke basen i Base Defense 3D.
