En modig kommandosoldat, der ikke kender til frygt, vil gå i kamp med terrorister i spillet Pixel Commando. Han gik direkte ind i terrorhulen, hvor militante baser er gemt, for at ødelægge banditformationerne i opløbet. Hjælp helten, uanset hvor modig han er, bliver han nødt til at kæmpe alene mod en hær af bøller. Men helten mister ikke modet, han går muntert gennem junglen og skyder mod de militante, der dukker op i skudlinjen. En magtfuld boss vil være den sidste, din helt ødelægger i Pixel Commando. Styr ham behændigt, så han forbliver i live og med succes når slutningen af hvert niveau.
