En epidemi har ramt byer og byer i Outbreak Ops. Karantænezoner blev dannet for at afvente ankomsten af en vaccine, men antallet af inficerede mennesker steg, og det begyndte at mutere. Ingen vaccine kan bringe mutanten tilbage til menneskelig form, så det blev besluttet at udføre en udrensning i karantænezonerne. Din helt vil gå for at fuldføre opgaver, og du vil hjælpe ham. Hans mission vil blive til overlevelse, fordi der er for mange mutanter i Outbreak Ops. Du bliver nødt til at bevæge dig hurtigt for at undgå at blive omringet.