Efter en række menneskeskabte katastrofer er planeternes økologi blevet meget forværret, og det er blevet svært for mennesker at leve. Mutanter dukkede op, som hurtigt tilpassede sig nye forhold. Deres blod kan blive grundlaget for at skabe en vaccine, der vil hjælpe almindelige mennesker til at blive stærkere og sundere. Helten i spillet Mutant Blood er en verdensberømt videnskabsmand, der forenede alle de smarte hoveder på planeten for at skabe en vaccine. Arbejdet er begyndt i alle de hemmelige laboratorier, men de, der ønsker at blande sig i processen i Mutantblood, er dukket op - det er ekstremister.
