Den modige ninja fik mange fjender på grund af sin integritet og kompromisløse holdning til alt, der forårsager skade på uskyldige mennesker. I spillet Ninjas Return vil du møde helten på en af de mørkeste dage i hans liv. Han vendte hjem, men i stedet for et glædeligt møde med sin familie, var han vidne til, hvordan hans fjende, den sorte ninja, kidnappede hans kone og tog ham til en ukendt retning. Helten går straks i jagten, men fjenden er forberedt, han vil forsøge at stoppe helten ved hjælp af sine håndlangere og skovmonstre i Ninjas Return.
