Når der opstår en form for ubalance i naturen, fører det til alvorlige konsekvenser. Mennesket har gjort en stor indsats for at forstyrre den naturlige harmoni i havene, som følge heraf er bestanden af rovfisk steget betydeligt. Dette truer med at ødelægge den marine fauna, og der skal gøres noget ved det. I spillet Aquava nærmer du dig problemet radikalt – ved at ødelægge den skurkefisk. Klik blot på den valgte fisk, og den forsvinder, og du går videre til den næste. Tiden er begrænset til tredive sekunder i Aquava. Du vil ikke være i stand til at blive under vand længere.
