Pixelbillederne, der vil blive præsenteret for spillere på hvert niveau i Pixel Paint Sort-spillet, er beskadiget. Pixels i dem er blandet sammen, og din opgave er at sortere og returnere pixels til deres steder. Du skal starte processen ved at fjerne nogle af pixels; de kan placeres på hjælpepanelet under billedet. Dernæst kan du overføre nogle af pixels direkte i billedet til det frigjorte område. På denne måde flytter du pixels, indtil du vender dem tilbage til deres plads. Når dette sker, vil billedet blive gendannet i Pixel Paint Sort.
