Zombie-udbruddet er lige begyndt i Shooter: Outbreak Protocol, men det spreder sig hurtigt. The Umbrella Corporation blev dens kilde og forsøgte at skjule lækagen af virussen, som førte til mange inficerede mennesker, og nu bliver det stadig sværere at håndtere dem. Du er bosiddende i Raccoon City og ønsker at komme ud af byen, før den er fuldstændig blokeret, selvom sådanne forsøg allerede bliver gjort. Det er nemmere at komme igennem checkpointene om natten, men det er på dette tidspunkt, at zombier er særligt aktive. Forbered dine våben, du vil have seks typer at vælge imellem i Shooter: Outbreak Protocol.
