Mario sadlede en skal fra en kanon og skynder sig mod fjender, alle der ønsker at ødelægge sit indfødte Mushroom Kingdom. Og der var mange mennesker, der ønskede at fange Mario -platformens verden, de flyver, løber, kravler og alle skyder eller forsøger at bide, som kødædende planter, der springer ud af rør. Kontroller helten i Super Mario Defend, så han undgår skade, men samtidig skyder uafbrudt, ellers vil det være for sent. Blikkenslagerens våben er super moderne og ikke engang terrestrisk, men fremmed i oprindelse, det gik til helten efter en kamp med robotter. Vi ser, at de rolige tider hører fortiden til, Mario bliver nødt til at blive en rigtig kriger i Super Mario Defend.