Nindroidov enorme hær gjorde oprør og begyndte at erobre planeten. Modige helte af spillet "Go Ninja: Rise Nindroidov" forsøger at stoppe oprøret, og til dette, de har brug for at komme til fjendens base og ødelægge leder. Forud for en lang vej, kan du spille for hver ninja, der er i spillet. Forskellige situationer kræver forskellige tegn. Ændre tegnene kommer til live i spillet i en særlig portal. Hvis du ønsker at bryde barrieren, fremkalde stærke ninja med en økse, hakke det i stykker alle. Saml undervejs medicinskabet, men snarere forsøge at holde ud fjender.
